由于目前的分離技術(shù)是基于外泌體的大小、結(jié)構(gòu)和一些膜蛋白的捕獲，很難與其他囊泡和蛋白質(zhì)區(qū)分開，所以需要進行外泌體鑒定，外泌體的鑒定主要依賴形態(tài)學(xué)特征、顆粒大小、標志性蛋白等。

通過提取外泌體總蛋白，用Western Blot方法對目的蛋白進行相對定 量，了解其在外泌體中的富集情況，或通過特有外泌體標志物的 Western Blot鑒定說明樣本為外泌體。

根據(jù)國際囊泡協(xié)會規(guī)定，囊泡研究最小實驗要求，總體表征：至少要鑒定3個EVs陽性（至少有一個跨膜蛋白，一個細胞溶質(zhì)蛋白），1個EVs陰性蛋白標志物。