外泌體中的蛋白質(zhì)居多，外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用廣泛，研究外泌體蛋白質(zhì)在免疫調(diào)節(jié)、抗原呈遞、癌癥轉(zhuǎn)移、腫瘤浸潤、血管生成、神經(jīng)發(fā)育中的生物學(xué)功能，標(biāo)志物的篩選與鑒定、藥物靶點的發(fā)現(xiàn)以及功能機制中的作用以及疾病診斷、治療和預(yù)后等。

蛋白質(zhì)的差異表達(dá)是區(qū)分不同來源外泌體的重要特點，是研究外泌體起源的重要途徑。蛋白質(zhì)組學(xué)已經(jīng)逐漸成為研究各種亞細(xì)胞組分蛋白質(zhì)組的重要工具。針對外泌體進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)研究，可以揭示疾病發(fā)病機制、尋找疾病診斷和預(yù)后的生物標(biāo)志物、篩選疾病治療靶點等。