理論上講，細胞代數(shù)越靠前，干細胞的干性也越強。但是干細胞在體外培養(yǎng)的過程中，干細胞有從組織微環(huán)境到體外培養(yǎng)環(huán)境的一個調(diào)整和適應過程，一部分不適應的細胞會被淘汰，所以在前兩三代，干細胞基因組有著不穩(wěn)定的因素，可能不宜臨床應用。

有研究顯示，通過核型分析發(fā)現(xiàn)，在前三代細胞中，干細胞存在異常核型的比例偏高。就如間充質(zhì)干細胞（mesenchymal stem cells,MSCs）而言，臨床應用的最佳代數(shù)應該在4~6代。